Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RIPPLY1Q0D2K3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms