Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCBP1Q09161 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms