Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD47Q08722 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD47Q08722 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD47Q08722 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD47Q08722 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD47Q08722 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CD47Q08722 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms