Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CYP4F3Q08477 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
CYP4F3Q08477 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms