Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LRP1Q07954 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms