Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EXOSC9Q06265 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms