Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN1Q05586 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GRIN1Q05586 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms