Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
DSG1Q02413 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms