Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF17Q02223 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF17Q02223 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms