Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SCN7AQ01118 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms