Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CACNA1BQ00975 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CACNA1BQ00975 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms