Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HSF1Q00613 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HSF1Q00613 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms