Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CDK16Q00536 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CDK16Q00536 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms