Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2BQ00403 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms