Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SKOR1P84550 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SKOR1P84550 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms