Protein–RNA interactions for Protein: P82933

MRPS9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS9P82933 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS9P82933 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms