Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRB1P82279 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRB1P82279 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CRB1P82279 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms