Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNRPNP63162 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNRPNP63162 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms