Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RAB11AP62491 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms