Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ACTBP60709 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ACTBP60709 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms