Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTSWP56202 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTSWP56202 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTSWP56202 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTSWP56202 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CTSWP56202 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CTSWP56202 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms