Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ACLYP53396 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ACLYP53396 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACLYP53396 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACLYP53396 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACLYP53396 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACLYP53396 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms