Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
EFNA4P52798 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms