Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
SMARCA4P51532 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
SMARCA4P51532 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms