Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB5CP51148 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms