Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLK1P49759 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLK1P49759 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLK1P49759 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLK1P49759 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CLK1P49759 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms