Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA1P49639 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HOXA1P49639 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms