Protein–RNA interactions for Protein: P43699

NKX2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-1P43699 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NKX2-1P43699 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NKX2-1P43699 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms