Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MCAMP43121 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MCAMP43121 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCAMP43121 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MCAMP43121 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MCAMP43121 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms