Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LTBRP36941 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LTBRP36941 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LTBRP36941 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LTBRP36941 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LTBRP36941 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms