Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GPC1P35052 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GPC1P35052 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GPC1P35052 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms