Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TSPOP30536 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
TSPOP30536 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TSPOP30536 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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