Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TM4SF1P30408 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM4SF1P30408 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms