Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
DNMT1P26358 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC29.39■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
DNMT1P26358 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms