Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ITGA3P26006 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms