Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
LMO2P25791 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
LMO2P25791 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
LMO2P25791 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms