Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPS6KB1P23443 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RPS6KB1P23443 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms