Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

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Length 2,839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NF1P21359 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NF1P21359 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NF1P21359 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NF1P21359 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NF1P21359 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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