Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNB1P20700 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNB1P20700 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms