Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRIM21P19474 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRIM21P19474 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms