Protein–RNA interactions for Protein: P18754

RCC1, Regulator of chromosome condensation, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC1P18754 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RCC1P18754 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RCC1P18754 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RCC1P18754 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RCC1P18754 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms