Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EGR1P18146 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR1P18146 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR1P18146 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR1P18146 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
EGR1P18146 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
EGR1P18146 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms