Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF4P18085 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ARF4P18085 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ARF4P18085 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ARF4P18085 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ARF4P18085 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF4P18085 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF4P18085 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF4P18085 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF4P18085 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ARF4P18085 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms