Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYN1P17600 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYN1P17600 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYN1P17600 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYN1P17600 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYN1P17600 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYN1P17600 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYN1P17600 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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