Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCFC2P16383 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCFC2P16383 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms