Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
VPREB1P12018 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
VPREB1P12018 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms