Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TOP2AP11388 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TOP2AP11388 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms