Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
COX5BP10606 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
COX5BP10606 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
COX5BP10606 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
COX5BP10606 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
COX5BP10606 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms