Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PARP1P09874 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PARP1P09874 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PARP1P09874 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms