Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NMBP08949 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NMBP08949 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NMBP08949 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NMBP08949 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NMBP08949 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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NMBP08949 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NMBP08949 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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NMBP08949 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NMBP08949 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NMBP08949 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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